这部剧最戳人的地方，是工藤新一明明是个高中生侦探，却因为目击黑暗组织的地下交易被偷袭灌药，醒来后发现自己变成了小学生的模样。为了不连累身边的人，他化名江户川柯南，在阿笠博士的建议下住进了女友毛利兰的家里。最遥远的距离，大概就是兰近在眼前，却认不出眼前这个小孩就是自己的男朋友。 故事里，柯南靠着原本的推理天份，配合阿笠博士为他发明的各种道具，暗中帮毛利小五郎