故事从大学新鲜人泽木惣右卫门直保踏进农业大学农学部开始。其貌不扬的他藏着一个天大的秘密——能看见漂浮在空气中的「菌」，甚至徒手抓住它们、和它们对话。对学农业的直保来说，这能力简直如虎添翼，可麻烦也跟着一桩桩找上门。 青梅竹马结城萤家里经营酿酒业，直保的秘密自然成了他酿酒路上的大帮手。而外表意外老成的学长美里熏、各方面都圆滚滚的川滨拓马，也对这个能跟菌打交道