故事紧接上部，收复玉龙国、打败天地盟主之后，神兵小将们本以为能过上安稳日子。可黑暗势力从没死心，元始天魔把琉璃国国王变成了黑暗傀儡玄天邪帝，转头就侵略玉岛国——玉龙国的姊妹国。玉岛国元首玉燕的首席侍卫宗主的女儿灵剑双子，奉命驾驶女娲星船去玉龙国接南宫逸支援。没想到南宫逸不在家，阴差阳错把问天、问雅、小龙和天晶兽接了过来。玉龙国元首得知后，立刻用水晶球通知其他