故事设定在近未来，人类的思考与情感被量化为「e-脉冲」，成为AI设备「辅助蛋」的能源。生活看似更便利了，可暗处却冒出了以吞噬e-脉冲为生的怪物——数码兽。2050年5月的光滨市，少年天马智郎原本过着普通日子，直到一只守宫兽突然从辅助蛋中现身，他的世界彻底被掀翻。 被卷入非日常后，天马智郎遇上了以赚取赏金为生的「闪耀黎明」团队，成员泽城京等人带着他一起行动。