故事设定在不久的将来，海平面不明原因上升，大部分陆地沉入水下。少年斑鸠夏生因幼年事故失去一条腿，厌倦了城市，独自搬到海边小镇。他无依无靠，唯一遗产是海洋地质学家祖母留下的一艘船、一艘潜水艇，还有一身债务。为了找回失去的未来，夏生潜入祖母的海底仓库，发现一个棺材般的装置，里面沉睡着神秘少女亚托莉——一个极其精巧、情感丰富的机器人。 被从海底打捞上来后，亚托莉